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  • MetCore de la Vicerrectoría de Investigación y Creación de la Universidad de los Andes

Metcore es el primer Core Facility en Metabolómica de Colombia y uno de los primeros en Latam. Brinda acceso a la última tecnología de análisis de metabolitos y colabora activamente en el desarrollo de proyectos y experimentos con metabolómica.

Metcore presta servicios especializados, participa en proyectos de investigación y realiza actividades de formación en análisis metabolómico en diferentes sectores, de biomedicina, alimentos, biotecnología, entre otros.

INFRAESTRUCTURA

  • Procesamiento de datos

    MetCore
  • Análisis de muestras

    MetCore
  • Análisis de datos

    MetCore
  • Análisis de muestras

    Análisis de muestras

    MetCore
  • Procesamiento de datos

    Procesamiento de datos

    MetCore
  • Laboratorio MetCore

    Laboratorio MetCore

    MetCore
  • Preparación de muestras

    Preparación de muestras

    MetCore

    Te ayudamos a diseñar tus análisis metabolómicos para que obtengas resultados confiables y de alta calidad.

    Nuestro flujo de trabajo nos permite ser flexibles y  realizar los análisis metabolómicos según tus necesidades

    Profesionales con amplia experiencia en la química analítica, especialmente en metabolómica  y lipidómica.

    Podrás realizar el servicio de análisis metabolómico completo o escoger las etapas del análisis metabolómico que requieres.

    Infraestructura moderna dedicada al análisis metabolómico y lipidómico, siguiendo las recomendaciones de QA & QC en análisis metabolómico.

    Contamos con librerías de estándares con más de 2000 metabolitos que nos permite llegar a niveles de identificación más altos (Nivel 1)

    Brindamos una solución completa de análisis metabólico desde la preparación de muestras hasta el procesamiento y análisis de datos.

    Preparación de muestras

    Ultracongeladores, Congeladores Refrigeradores, Cabina de Bioseguridad Clase II Tipo B2, Microcentrífuga Refrigerada, SpeedVac, TissueLyser, Purificador de Agua Tipo I.

    Análisis de la muestra
    • Agilent LC 1260
    • Agilent CE 7100
    • Agilent Q/TOF 6545
    • Agilent GC-Q/TOF 7200
    • Agilent QqQ 6470
    Procesamiento y análisis de datos
    • Agilent Mass Hunter: Profinder, Profiler Professional (MPP), Unkonwn Analysis, lipid annotator.
    • SIMCA, Matlab, MetaboAnalyst
    • CFM-ID, MS-DIAL, CEU Mass mediator, HMDB, METLIN, Lipid maps, MetFrag, Mass Bank, KEEG, among others.
    • Librerias “In house” con más de 2000 estándares de metabolitos
    MetCore, Uniandes. Agilent Technologies GC-QTOF 7200
    GC-QTOF-MS

    Agilent-GC-Q-TOF

    MetCore, Uniandes. Agilent Technologies MS-QTOF6545
    LC/CE-QTOF-MS

    Agilent-Q-TOF

    MetCore, Uniandes. Agilent Technologies LC/CE-QqQ-MS
    LC/CE-QqQ-MS

    Agilent QqQ 6470

    FLUJO DE TRABAJO

    Flujo de trabajo MetCore
    Preparación de muestras

    Se realiza la extracción de metabolitos según los protocolos previamente establecidos en el Centro. En los casos que se requiera una preparación de muestras diferente, esta debe ser realizada por el cliente o solicitarse como servicio personalizado.

    Análisis de muestras

    Análisis no dirigido por la plataforma seleccionada, GC-MS, HPLC-MS, CE-MS.

    Procesamiento de datos

    Incluye los pasos de deconvolución, alineamiento, integración y filtrado de los datos, generando una matriz de datos las características moleculares (molecular feature) con la respectiva abundancia en cada muestra. Esta matriz de datos se entrega en un archivo Excel, el cual se encuentra listo para el análisis de datos.

    Análisis de datos

    Análisis de datos univariado y/o multivariado permitiendo seleccionar los metabolitos responsables de las diferencias entre grupos. Curvas ROC.

    Identificación de metabolitos

    Anotación de los metabolitos responsables de las diferencias entre grupos empleando librerías comerciales, libres e in-house.  Cada metabolito es reportado en el respectivo nivel de identificación según las “Metabolomics Standards Initiative guidelines(Blaženović, I.; Kind, T.; Ji, J.; Fiehn, O. Software Tools and Approaches for Compound Identification of LC-MS/MS Data in Metabolomics. Metabolites 2018, 8, 31).

    Análisis de rutas biológicas

    Análisis de enriquecimiento, análisis de rutas alteradas.

    SERVICIOS

    Investigamos y prestamos servicios especializados en metabolómica

    Metabolómica no dirigida

    Los análisis de  metabolómica no dirigida se realizan con espectrometría de masas de alta resolución empleando un cuadrupolo acoplado a un tiempo de vuelo (Q-TOF) acoplado a diferentes sistemas de separación como cromatografía de gases, líquidos y electroforesis capilar.

    • Análisis metabolómico no dirigido por GC-QTOF-MS.
    • Análisis metabolómico no dirigido por RP-HPLC-QTOF-MS.
    • Análisis metabolómico no dirigido por HILIC-HPLC-QTOF-MS.
    • Análisis metabolómico no dirigido por CE-QTOF-MS

    Para los análisis no dirigidos se ofrece el servicio completo o parcial según el interés del cliente.

    Perfiles metabólicos

    Determinación de metabolitos y lipidos en matrices biológicas empleando HPLC-QQQ-MS

    Lipidómica no dirigida

    Los análisis de  lipidómica no dirigida se realizan con espectrometría de masas de alta resolución empleando un cuadrupolo acoplado a un tiempo de vuelo (Q-TOF) acoplado a cromatografía de  líquidos.

    • Análisis lipidómico no dirigido por RP-HPLC-QTOF-MS and HILIC-HPLC-QTOF-MS.

    Para los análisis no dirigidos se ofrece el servicio completo o parcial según el interés del cliente.

    Metabolómica y lipidómica dirigida

    Determinación y cuantificación de metabolitos en matrices biológicas empleando HPLC-QQQ-MS

    • Cuantificación de Cortisol y cortisona
    • Cuantificación de Ceramidas.

    Desarrollo de métodos de análisis para cuantificación de metabolitos.

    Caracterización de metabólitos
    • Caracterización de metabolitos en matrices biológicas empleando GC-QTOF-MS.
    • Caracterización de metabolitos en matrices biológicas empleando RP-HPLC-QTOF-MS.
    • Caracterización de lipidos en matrices biológicas empleando RP-HPLC-QTOF-MS.

    Los metabolitos y lípidos son caracterizados empleando diversas librerías disponibles en MS-DIAL, Fiehn, NIST, así como las librerías in-house construidas con datos experimentales adquiridos en nuestros equipos usando las librerías de  IROAC: Mass Spectrometry Metabolite Library of Standards (MSMLS)” la cual es una colección de 600 pequeñas moléculas bioquímicas de gran pureza que abarcan una amplia gama del metabolismo primario, y Phytochemical Metabolite Library of Standards (PHYTOMLS)  la cual es una colección de 364 fitoquímicos de alta calidad producidos por  plantas.


           EQUIPO

    PhD. Mónica Cala

    Líder e investigadora MetCore

    Química, magíster en Química y Doctora en Ciencias Químicas. 

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    Ver perfil ORCID
    Ver CvLAC


    CONTACTO

    metcore@uniandes.edu.co 
    Conmutador (601) 3394949 
    Extensión 1429

    Universidad de los Andes
    Carrera 1 N° 18a-10, Bloque Q, Q-300
    Bogotá, Colombia 

    • MSc. Mary Santamaria

      Analista de laboratorio
      prueba

      Química, magíster en Ciencias Biológicas.

    • BSc. Lizeth León

      Analista de laboratorio
      prueba

      Química, candidata a magíster en Ciencias – Bioquímica.

    • PhD. Daniel Pardo

      Profesional proyectos de investigación
      prueba

      Biólogo, magíster en Ciencias Biológicas y doctor en Ciencias Biológicas.

      • PhDc. Laura Rojas

        Profesional proyectos de investigación
        prueba

        Licenciada en Química, magíster en Ciencias Biológicas y candidata a doctora en Ciencias Biológicas.

      • PhD. Luis Chitiva

        Profesional proyectos de investigación
        prueba

        Licenciado en Química, magíster en Química, doctor en Ciencias Biológicas y en Ciencias Químicas.

      • PhDc. Ana León

        Auxiliar proyectos de investigación
        prueba

        Química, magíster en diseño de procesos y productos y candidata a doctora en Ingeniería.


        Centro de investigación en Metabolómica 
        MetCore (COL0220419)

        Nuestro principal objetivo es facilitar e impulsar la investigación en metabolómica en nuestro país y región. En MetCore colaboramos de manera activa en el desarrollo de proyectos y experimentos con metabolómica en diversas áreas de investigación.

        • BIOMEDICINA: Diagnóstico de enfermedades, diagnóstico y fisiopatología.
        • ALIMENTOS: Producción y procesamiento industrial de alimentos.
        • BIPROSPECCIÓN: Alternativas terapéuticas y fitoterapéuticas.

        Nuestros socios

        MetCore hace parte de una alianza estratégica con AGROSAVIA, Pontificia Universidad Javeriana y Universidad del Rosario, donde se busca promover la cooperación académica a través de la investigación entre las diferentes instituciones.